Колонію було утворено в 1967 році. Перші вихованки (152 дівчини) прибули до Мелітополя зі Старобельської ВТК. Ці дівчата були розбещені, не хотіли працювати та не підкорялися режимним вимогам.

З часом педагогічний колектив установи кардинально переломив ситуацію і сьогодні Мелітопольська виховна колонія справедливо вважається однією з найкращих серед спеціальних виховних установ.

У різні роки установу очолювали Ворнік З.С., Мінєєва Н.І., Васильченко Д.В., Демченко А.А.