Самая старая колония в Новгородской области - ФБУ ЛИУ-3 (г. Боровичи). Начало ее существования следует относить к 1939 году, когда приказом НКВД № 389 было создано Управление строительства ГЭС на реке Мста. Вместе с Управлением образовывается Мстинский исправительно-трудовой лагерь, куда первые заключенные стали поступать в конце 1939 года. В течение 1940 года их численность достигла 40 тысяч человек (в то время в Боровичах проживало 35 тысяч человек). Заключенные размещались по лаготделениям близ строительства ГЭС, ими было заселено и здание бывшей Спасской церкви. Значительная часть находилась в селе Егла. До начала военных действий 1941 года строители соорудили систему канала в обход Мсты и котлован ГЭС. С началом войны работы приостановились, часть заключенных призвали в армию, других направили на строительство оборонных сооружений. В феврале 1942 года на территории лагеря создается сборно-пересыльный пункт для бывших военнослужащих Красной Армии, попавших в плен или вышедших из окружения. Через него прошло 1783 бывших военнослужащих. В том же году пункт преобразовывается в лагерь-распределитель НКВД СССР для военнопленных и становится одним из лаготделений лагеря № 270, через который прошли более 57 тысяч человек. Среди военнопленных были поляки, немцы, мадьяры, румыны, испанцы... Они размещались в лагерных отделениях, количество которых менялось от 3 до 16 в разные годы.
В послевоенное время учреждение представляло собой один из многочисленных островков «архипелага ГУЛАГ», в котором содержалось более 100 человек. В 1951 году его расформировали. Содержащиеся военные преступники, в основном бандеровцы, 1231 человек, были отправлены в Свердловскую область. В освободившиеся бараки переводится ИТК-8, которую в 1953 году переименовывают в ИТК-3. Это название колонии сохраняется до 2005 года. Большие изменения происходили в колонии в 1964 году, когда она была преобразована в колонию строгого режима для отбывания наказания осужденных больных туберкулезом. А в 1965 году реорганизована в межобластную колонию для лечения осужденных, больных туберкулезом. Долгое время она являлась школой передового опыта и практически единственным учреждением на Северо-Западе по лечению больных туберкулезом.
В июне 2001 года в Новгородской области работала оценочная комиссия ВОЗ. В соответствии с Европейскими пенитенциарными правилами, специалисты Совета Европы и ВОЗ разработали и рекомендовали для внедрения программу по борьбе с туберкулезом среди спецконтингента в учреждениях УИС Новгородской области. В рамках этой программы в ИК-3 было организовано контролируемое лечение больных туберкулезом. В результате первичная выявляемость заболеваний активными формами туберкулеза легких среди спецконтингента за 2001 год по сравнению с предыдущим годом снизилась более чем на треть, а смертность - наполовину.
В ЛИУ-3 успешно развивается и производство. Половину его объемов составляет продукция деревообработки, около трети - металлоизделия. Цехи столярный и металлообработки работают по кооперации с боровичскими и московскими предприятиями. В частности, немалым спросом у них пользуются изготавливаемые в колонии мастерки, кельмы, молотки, рубанки, отвесы и прочий инструмент. В 2003 году рубанки были отмечены во Всероссийском конкурсе ФСИН по качеству изделий, выпускаемых учреждениями УИС. Их разрешено маркировать логотипом медали «Гарантия качества и безопасности», которой ФСИН (тогда ГУИН) была награждена за участие в международной выставке продукции «Национальная безопасность».
В колонии имеется также швейный цех, свое подсобное хозяйство и пекарня, которые работают на нужды самого ЛИУ-3. В колонии самая высокая среди исправительных учреждений области средняя зарплата у заключенных.
По итогам первого полугодия 2005 года учреждение ФБУ «ЛИУ-3» заняло 3 место во Всероссийском смотре-конкурсе на лучшее учреждение УИС по служебной и производственно-хозяйственной деятельности, достигнув заметного оздоровления экономики, эффективного использования труда осужденных.
Еще одного призового места по итогам 2005 года лечебно-исправительная колония удостоена в смотре-конкурсе ФСИН за результаты по экономии и эффективному использованию топливно-энергетических ресурсов.
В 2003 году исполком общероссийского общественного движения «За права человека» признал исправительное учреждение ЛИУ-3 г. Боровичи одним из лучших среди российских колоний по условиям жизни для заключенных. К такому выводу правозащитная организация пришла, проведя анкетирование среди осужденных по условиям содержания и отношения к осужденным сотрудников учреждения. ЛИУ-3 первой в Новгородской области в 1998 году построило храм для нужд верующих.
В колонии трудится более пятнадцати династий сотрудников. Одна из самых известных - династия Диановых. Основатель династии врач-фтизиатр Лариса Петровна Дианова первая из сотрудников УИС области была награждена почетной среди медицинских работников УИС медалью Федора Газа.
В 2009 году в ЛИУ-3 сдано в эксплуатацию новое общежитие для осужденных Общежитие рассчитано на 100 человек, в каждой комнате будут проживать 3-4 осужденных. Оборудовано современной мебелью, сантехникой, комнатами для воспитательной работы.
